Основная образовательная программа подготовки магистра прикладной математики и информатики реализуется в соответствии с самостоятельно устанавливаемым МГУ имени М.В. Ломоносова образовательным стандартом высшего образования по направлению «Прикладная математика и информатика».
Магистерская программа «Математическое моделирование» нацелена на подготовку специалистов, способных внедрять в своей научной и производственной деятельности триаду «модель – алгоритм – программа», кратко выражающую суть понимания термина, указанного в её названии. Выпускники способны на основе исследования различного рода явлений, от естественнонаучных до экономических и социальных, строить средствами современной математики модели, корректные как с математической, так и с вычислительной точек зрения, то есть применять такой аппарат, который позволяет исследовать задачи до конечного этапа их понимания на основе проведения вычислительного эксперимента. Последнее означает свободное владение не только глубокими знаниями в области математического и численного анализа, но и твёрдые навыки в программировании, включая использование высокопроизводительных вычислительных комплексов. Мировая практика показывает, что сам способ мышления, приобретаемый благодаря опыту математического моделирования, является основой для новых идей и разработок, без чего невозможно достижение надёжных позиций в конкурентно острой глобальной среде.